1. Lacs de montagnes, très poissonneux, sont :

• le lac Albert, un des plus poissonneux du monde, occupe le fond des fossés tectoniques de l'est du pays.

• le lac Tanganyika, 32.000 km² de surface (approximativement la même superficie que la Belgique), 650 km de long, 80 km de large, est le second du monde par sa profondeur (1.470 m) après le lac Baïkal (1.741 m). Il déverse ses eaux dans le fleuve Zaïre par la Lukuga.

• le lac Kivu situé à 1.470 m d'altitude est relié au lac Tanganyika par la rivière Ruzizi.

• le lac Edouard, à 916 m d'altitude, a 2.150 km² de surface et déverse ses eaux dans le lac Albert par la Semliki; ils appartiennent tous deux au bassin du Nil.

2. Lacs de plateau :

Le lac Moero et le lac Bangwelo

3. Lacs résiduels :

Les lacs Tumba et Maindombe, témoin de l'ancienne mer intérieure qui occupait la zone déprimée de la cuvette centrale. Il existe de nombreux autres lacs, mais de moindre importance.